昆明醫科大學是云南省最大的集教學、醫療、科研為一體的高等醫學院校,其前身是創建于1933年的東陸大學醫學專修科,1956年獨立建院。學校自1979年開始招收培養研究生,1981年被國務院學位委員會批準為國家首批碩士學位授予單位,1998年被國務院學位委員會批準為博士學位授予單位,2000年和2003年分別成為臨床醫學、口腔醫學碩士專業學位授權試點單位,2006年獲教育部批準具有推薦優秀應屆本科畢業生免試攻讀碩士學位研究生工作資格,2009年被國務院學位委員會批準具有公共衛生碩士專業學位授權。2011年獲得了臨床醫學一級學科博士學位授予權,2014年獲應用心理、藥學、護理碩士專業授予權。2018年獲得了基礎醫學、藥學一級學科博士學位授予權,臨床醫學博士專業學位授予權。2021年獲口腔醫學、公共衛生與預防醫學一級學科博士學位授予權,口腔醫學博士專業學位授予權,生物學獲一級學科碩士學位授予權。
目前,學校有一級學科博士學位授權點5個(基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、公共衛生與預防醫學、藥學),專業博士學位授權點2個(臨床醫學、口腔醫學);一級學科碩士學位授權點8個(基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、公共與預防醫學、藥學、護理學、醫學技術、生物學),碩士專業學位授權點6個(臨床醫學、口腔醫學、公共衛生、藥學、護理、應用心理)。學校現有研究生二級培養單位30個,省級研究生教育創新聯合培養基地3個,省級專業學位研究生聯合培養基地2個。學校現有博士研究生導師276名,碩士研究生導師1417名,在校研究生5507人。學校還開展同等學力申請碩士學位工作,至今已培養各類研究生萬余名。